本發(fā)明公開了一種生產(chǎn)紐莫康定B0的基因重組菌株及選育方法和應(yīng)用，所述的基因重組菌株菌株分類命名為Glarea?lozoyensis?Q45，保藏登記號為CCTCC?NO：M2014416，保藏日期為2014年9月14日；選育該菌株的方法是將出發(fā)菌株制成原生質(zhì)體，利用離子注入和氯化鋰處理獲得由多株突變菌株組成的突變庫，突變庫再次制成原生質(zhì)體，將離子注入滅活和熱滅活的原生質(zhì)體進(jìn)行隨機(jī)融合，發(fā)酵篩選產(chǎn)量高的基因重組菌，然后將篩選得到基因重組菌再次經(jīng)過原生質(zhì)體制備、融合與融合子的篩選，得到本發(fā)明所述的基因重組菌。本發(fā)明提供的菌株性能優(yōu)良，生產(chǎn)能力穩(wěn)定，發(fā)酵得到紐莫康定B0產(chǎn)量達(dá)6g/L，且副產(chǎn)物少，降低了紐莫康定B0后提取難度，有利于其在制備高品質(zhì)的卡泊芬凈中的應(yīng)用，具有重要的工業(yè)價值。