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利用計算機模擬計算蛋白質與DNA之間作用力的方法

958   編輯：管理員   來源：中冶有色技術網  
2023-03-19 07:31:07
本發(fā)明公開了一種利用計算機模擬計算蛋白質與DNA之間相互作用力的方法。該方法利用NAMD_2.6計算軟件和VMD-1.8.6分析軟件進行分子動力學模擬,首先將PDB數據庫的蛋白質結構制成適當的研究體系,然后對該體系進行能量最小化處理,將體系加熱到設定溫度后,對體系進行多步平衡處理,接著對體系實施分子動力學模擬,然后標記體系中目標研究對象并對體系進行SMD模擬,最后處理和分析數據得到蛋白質與DNA之間的相互作用力變化情況,并求得它們之間的最大相互作用力。該方法測定對象范圍廣泛、實驗材料易于制備、設備要求低并且利用率高,便于在與分子識別和基因表達行為相關的生命科學和物理化學以及醫(yī)藥領域廣泛應用。
聲明：
“利用計算機模擬計算蛋白質與DNA之間作用力的方法” 該技術專利(論文)所有權利歸屬于技術(論文)所有人。僅供學習研究，如用于商業(yè)用途，請聯(lián)系該技術所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)
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