一種從酵母廢水中提取天然甜菜堿的方法，包括下列步驟：步驟1：對(duì)酵母廢水進(jìn)行除雜預(yù)處理；步驟2：將步驟2得到的預(yù)處理后的液體引入到超濾膜系統(tǒng)，在1?5公斤壓力下進(jìn)行錯(cuò)流過濾，得到濃縮3?10倍后的濃縮液；步驟3：將步驟2得到的濾出液引入到連續(xù)式層析系統(tǒng)，得到富含甜菜堿的提取液組分和富含鹽分及其它雜質(zhì)的提余液組分；步驟4：對(duì)富含甜菜堿的提取液進(jìn)行脫色和濃縮處理，得到質(zhì)量分?jǐn)?shù)為50%?85%的甜菜堿液體產(chǎn)品；或者對(duì)富含甜菜堿的提取液進(jìn)行冷卻結(jié)晶或蒸發(fā)結(jié)晶，得到純度為95?99.9%的高純度天然甜菜堿結(jié)晶產(chǎn)品。本發(fā)明在經(jīng)過預(yù)處理過程后，采用連續(xù)層析技術(shù)分離甜菜堿，過程中不需要添加任何化學(xué)品，屬于高效的物理分離過程，運(yùn)行成本低。