本發(fā)明涉及一種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)指紋數(shù)據(jù)庫,屬于生物信息學(xué)領(lǐng)域。包含四條表示蛋白結(jié)構(gòu)指紋的字符串,由氨基酸序列,蛋白質(zhì)折疊形狀碼,物理化學(xué)性質(zhì)和向量偶合組成。所述蛋白質(zhì)折疊形狀碼,為27個(gè),由26英文字母加上“$”符號(hào)組成,對應(yīng)27個(gè)描述五個(gè)連續(xù)氨基酸殘基的折疊形狀的向量;物理化學(xué)性質(zhì)表示每一個(gè)氨基酸殘基側(cè)鏈的物理化性質(zhì),用7個(gè)字符分別表示。相鄰的兩個(gè)肽段共用四個(gè)氨基酸形成向量耦合。使用本發(fā)明的數(shù)據(jù)庫,可以大大減少數(shù)據(jù)儲(chǔ)存量,加快了檢索速度,擺脫必須依賴超級(jí)大型計(jì)算機(jī)或者大量計(jì)算機(jī)組合資源的局面,可以實(shí)現(xiàn)個(gè)人電腦運(yùn)作。
聲明:
“蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)指紋數(shù)據(jù)庫” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請聯(lián)系該技術(shù)所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)