本發(fā)明公開一種LncRNA和環(huán)境因素關(guān)聯(lián)關(guān)系的高效預(yù)測方法，主要包括以下步驟：1、下載數(shù)據(jù)集，得到LncRNA和環(huán)境因素(EF)的列表，和二者關(guān)聯(lián)關(guān)系的關(guān)聯(lián)矩陣A；然后分別計算出LncRNA和EF的高斯相互作用屬性核相似矩陣KL、KE。2、計算EF之間的化學(xué)結(jié)構(gòu)相似性矩陣E。3、將KL進(jìn)行邏輯斯蒂函數(shù)轉(zhuǎn)換，得到相似矩陣SL；且利用E和KE構(gòu)建EF的相似矩陣SE。4、融合A、SL和SE構(gòu)建一個全局異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)G；利用重啟隨機(jī)游走計算擴(kuò)散特征，并使用奇異值分解降維。5、計算lncRNA?EF對的Hetesim得分。6、結(jié)合擴(kuò)散特征和HeteSim得分得到特征數(shù)據(jù)集并用于訓(xùn)練梯度提升樹分類器去預(yù)測LncRNA?EF的關(guān)聯(lián)關(guān)系。7、使用10折交叉驗證方法對提出的方法進(jìn)行驗證。應(yīng)用本發(fā)明預(yù)測LncRNA和EF關(guān)聯(lián)關(guān)系的精度高。