本發(fā)明屬于分析化學(xué)檢測領(lǐng)域，尤其涉及一種用于檢測真菌毒素的自動化設(shè)備和方法。該自動化設(shè)備包括控制電路系統(tǒng)、樣品前處理系統(tǒng)、熒光檢測系統(tǒng)和數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)。控制電路系統(tǒng)用于控制設(shè)備中各系統(tǒng)之間電信號的傳輸；樣品前處理系統(tǒng)通過管路與熒光檢測系統(tǒng)相連，將經(jīng)過前處理的樣品輸送至熒光檢測系統(tǒng)進行檢測；數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)與熒光檢測系統(tǒng)相連，接收其檢測得到的熒光信號，并經(jīng)數(shù)據(jù)處理后，獲得待測樣品中真菌毒素的濃度。本發(fā)明提供的用于檢測真菌毒素的設(shè)備中，熒光檢測系統(tǒng)設(shè)有多波長光源自動切換光學(xué)系統(tǒng)和多波長LED光源盤，可以根據(jù)需要自動切換紫外LED光源以產(chǎn)生不同波長的激發(fā)光，能夠滿足多種真菌毒素的同時檢測。