本發(fā)明屬于養(yǎng)殖廢棄物處理領(lǐng)域，具體涉及基于有機(jī)墊料的畜禽廢棄物循環(huán)系統(tǒng)及其運(yùn)行方法。本發(fā)明的發(fā)酵系統(tǒng)的養(yǎng)殖倉(cāng)包括高架網(wǎng)床、發(fā)酵層和污水調(diào)配層，高架網(wǎng)床上設(shè)置有機(jī)墊料，高架網(wǎng)床用于為畜禽提供生活空間；發(fā)酵層用于對(duì)高架網(wǎng)床產(chǎn)生的固體廢物進(jìn)行發(fā)酵；污水調(diào)配層的收集單元位于高架網(wǎng)床下方，用于收集養(yǎng)殖廢水，并通過管道輸送至發(fā)酵裝置；噴淋單元通過噴淋管與發(fā)酵裝置相連接，噴淋單元位于發(fā)酵層的正上方，可對(duì)發(fā)酵層進(jìn)行噴淋。本發(fā)明將養(yǎng)殖?固液分離?污水處理?固廢處理集成一體化，極大減小了設(shè)備數(shù)量和廠房占地面積，降低畜禽染病率，實(shí)現(xiàn)畜禽廢棄物減量化、資源化和能源化。