本發(fā)明提供了一種棉花種質(zhì)耐鹽性的高效鑒定方法，利用花缽?fù)僚嘤绶▽⒚藁ㄓ酌缗囵B(yǎng)至三葉一心期，選長(zhǎng)勢(shì)正常一致的材料分別進(jìn)行鹽脅迫處理和同體積的清水處理，選擇第二片真葉分別測(cè)定不同處理的PSII最大光化學(xué)效率，計(jì)算相對(duì)值，帶入耐鹽指數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)方程D=1.943X-0.882中計(jì)算耐鹽指數(shù)，確定耐鹽性；其中X為PSII最大光化學(xué)效率相對(duì)值，D為耐鹽指數(shù)。耐鹽指數(shù)越大，耐鹽性越強(qiáng)。與現(xiàn)有技術(shù)相比，本發(fā)明獲得的標(biāo)準(zhǔn)方程結(jié)果準(zhǔn)確可信，PSII最大光化學(xué)效率測(cè)定方法簡(jiǎn)單快速，可活體測(cè)定，不傷植株，保證下游實(shí)驗(yàn)的正常進(jìn)行。同時(shí)測(cè)定時(shí)期為棉花幼苗期，可以有效縮短鑒定時(shí)間，提高效率，適合進(jìn)行大規(guī)模種質(zhì)資源鑒定。