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miRNA和藥物耐藥性關聯(lián)的高效預測方法

908   編輯:管理員   來源:中冶有色技術網(wǎng)  
2023-03-19 07:28:46
本發(fā)明公開一種miRNA和藥物耐藥性關聯(lián)的高效預測方法,主要包括以下步驟:1、下載數(shù)據(jù)集,得到miRNA、藥物的列表,和關聯(lián)矩陣A;計算miRNA和藥物的高斯相互作用屬性核相似矩陣GSM、GSD;2、計算miRNA之間的序列相似性矩陣SSM,計算藥物之間的化學結構相似性ESD;3、利用GSM和SSM構建miRNA的相似矩陣SM;且利用GSD和ESD構建藥物的相似矩陣SD;4、融合A、SM和SD構建一個全局異構網(wǎng)絡G;利用傾斜重啟隨機游走計算擴散特征,并使用奇異值分解降維;5、計算miRNA?藥物對的Hetesim得分;6、結合擴散特征和HeteSim得分得到特征數(shù)據(jù)集,訓練支持向量機分類器去預測miRNA?藥物的關聯(lián)關系;7、使用10折交叉驗證方法進行驗證;應用本發(fā)明預測miRNA和藥物耐藥性關聯(lián)關系的精度高。
聲明:
“miRNA和藥物耐藥性關聯(lián)的高效預測方法” 該技術專利(論文)所有權利歸屬于技術(論文)所有人。僅供學習研究,如用于商業(yè)用途,請聯(lián)系該技術所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)
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