本發(fā)明公開了一種基于蛋白質(zhì)分子場預(yù)測相互作用位點(diǎn)的方法,首先搭建起一個(gè)GPU與CPU異構(gòu)的高性能集群計(jì)算平臺并建立優(yōu)化算法以進(jìn)行蛋白質(zhì)的復(fù)雜生物計(jì)算,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)相互作用的分子動力學(xué)模擬,從蛋白質(zhì)分子相互作用開始到結(jié)束,保存其中若干幀的位置信息,對每一幀計(jì)算蛋白質(zhì)分子場,最后分析蛋白質(zhì)中每一個(gè)殘基的分子場變化,找出變化最大的若干個(gè)殘基,即可能的相互作用位點(diǎn)。本發(fā)明利用建立的GPU與CPU異構(gòu)的高性能集群計(jì)算平臺及其優(yōu)化計(jì)算途徑,運(yùn)用量子化學(xué)計(jì)算蛋白質(zhì)分子場,具有較高的精度,可以方便、快速、有效地對蛋白質(zhì)相互作用過程進(jìn)行分析,對可能的作用位點(diǎn)具有較高的預(yù)測度,在生物計(jì)算領(lǐng)域具有很大的實(shí)用價(jià)值。
聲明:
“基于蛋白質(zhì)分子場預(yù)測相互作用位點(diǎn)的方法” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請聯(lián)系該技術(shù)所有人。
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