本發(fā)明提供了一種燃料化學(xué)品性質(zhì)建模預(yù)測方法及系統(tǒng)，包括：步驟1：選定研究的燃料化學(xué)品種類與性質(zhì)參數(shù)，采集燃料化學(xué)品測定的性質(zhì)參數(shù)實驗數(shù)據(jù)；步驟2：按照預(yù)設(shè)的輸入規(guī)范描述燃料化學(xué)品分子結(jié)構(gòu)；步驟3：將分子結(jié)構(gòu)作為輸入?yún)?shù)，燃料化學(xué)品性質(zhì)參數(shù)作為輸出參數(shù)，計算燃料化學(xué)品分子結(jié)構(gòu)的分子拓撲指數(shù)；步驟4：根據(jù)燃料化學(xué)品測定的性質(zhì)參數(shù)實驗數(shù)據(jù)、分子結(jié)構(gòu)和分子拓撲指數(shù)，建立活性子空間預(yù)測模型，得出預(yù)測的燃料化學(xué)品性質(zhì)參數(shù)。本發(fā)明建立起的活性子空間模型一方面能對燃料化學(xué)品性質(zhì)進行預(yù)測，以減小測量實驗工作量，另一方面可用于對燃料化學(xué)品分子結(jié)構(gòu)與性質(zhì)之間的關(guān)系與影響機理的研究。