本發(fā)明公開(kāi)了一種互補(bǔ)式電源的能量管理系統(tǒng)及其控制方法，且該能量管理系統(tǒng)包括能量管理單元、第一電池管理單元及第二電池管理單元，第一、第二電池管理單元均與能量管理單元通信連接；第一電池管理單元控制金屬燃料電池組，第二電池管理單元控制鋰電池組，金屬燃料電池組的輸出端連接第一直流直流變換模塊，鋰電池組的輸出端連接第二直流直流變換模塊；第一、第二直流直流變換模塊與直流交流變換模塊連接，直流交流變換模塊的輸出端連接負(fù)載；該控制方法包括正常工作模式和削峰填谷模式。本發(fā)明能保證互補(bǔ)式電源持續(xù)穩(wěn)定的功率輸出，優(yōu)化互補(bǔ)式電源能量管理過(guò)程，極大地降低了能量管理過(guò)程中的人力和物力。