本發(fā)明提供一種藥物?靶蛋白親和力預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)，屬于基于人工智能的生物信息處理技術(shù)領(lǐng)域，對(duì)待檢測(cè)的藥物?靶蛋白對(duì)中的藥物化學(xué)分子和靶蛋白分子分別進(jìn)行編碼，得到藥物輸入表示和靶蛋白輸入表示；利用藥物?靶蛋白親和力預(yù)測(cè)模型對(duì)所述藥物輸入表示和靶蛋白輸入表示進(jìn)行處理，得到藥物?靶蛋白親和力預(yù)測(cè)值。本發(fā)明利用元學(xué)習(xí)算法，有效挖掘了不同子任務(wù)之間的相關(guān)性；利用正則化項(xiàng)緩解不同子任務(wù)之間的任務(wù)不平等性，提高了藥物?靶蛋白親和力預(yù)測(cè)模型的任務(wù)自適應(yīng)性，獲得了具有泛化性能的藥物?靶蛋白親和力預(yù)測(cè)模型，提高了對(duì)未知藥物?靶蛋白對(duì)親和力預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性，有效解決了藥物?靶蛋白親和力預(yù)測(cè)方面的冷啟動(dòng)問(wèn)題。