本發(fā)明公開(kāi)了一種識(shí)別酪氨酸翻譯后修飾位點(diǎn)的預(yù)測(cè)算法,包括步驟:數(shù)據(jù)收集;數(shù)據(jù)處理;特征編碼;特征優(yōu)化;模型訓(xùn)練與評(píng)估。本發(fā)明還公開(kāi)了一種預(yù)測(cè)算法的應(yīng)用。從蛋白質(zhì)序列信息、進(jìn)化信息和物理化學(xué)屬性角度全面提取酪氨酸翻譯后修飾位點(diǎn)的特征,以Elastic?Net為優(yōu)化手段自動(dòng)選取變量對(duì)多維特征進(jìn)行篩選,去除冗余信息,且結(jié)合SVM構(gòu)建酪氨酸硝基化、硫化和磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)模型,提升預(yù)測(cè)模型的預(yù)測(cè)能力,顯著提高酪氨酸翻譯后修飾位點(diǎn)的預(yù)測(cè)質(zhì)量。開(kāi)發(fā)的預(yù)測(cè)軟件平臺(tái)TyrPred實(shí)現(xiàn)了對(duì)完整蛋白質(zhì)上酪氨酸硝基化、硫化和磷酸化三種修飾位點(diǎn)的預(yù)測(cè)分析,為酪氨酸翻譯后修飾的研究提供方便、經(jīng)濟(jì)、快捷的研究工具和重要參考。
聲明:
“識(shí)別酪氨酸翻譯后修飾位點(diǎn)的預(yù)測(cè)算法” 該技術(shù)專利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請(qǐng)聯(lián)系該技術(shù)所有人。
我是此專利(論文)的發(fā)明人(作者)