本發(fā)明公開了一種功能化的dCas9修飾蛋白及其在檢測核酸中的應(yīng)用，屬于生物工程技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明在dCas9基礎(chǔ)上修飾得到兩種功能化蛋白dCas9?biotin和dCas9?AP，在此基礎(chǔ)上構(gòu)建一種新型的檢測核酸的化學(xué)發(fā)光方法；其中，通過固相修飾的dCas9?biotin對DNA進(jìn)行特異性捕獲，通過堿性磷酸酶標(biāo)記的dCas9進(jìn)行定量檢測，可實(shí)現(xiàn)體系中0.42fmol核酸(3.6kbp)的檢出；dCas9?biotin和dCas9?AP的夾心識(shí)別更提高檢測體系的特異性，為進(jìn)一步降低核酸檢測假陽/假陰結(jié)果提供有效手段。