一種用于分析體液蛋白質(zhì)組的方法，該方法包括：采用親和技術去除初始樣品A中的高豐度蛋白，獲得低豐度蛋白富集的待測樣品I；采用化學沉淀法去除初始樣品B中的高豐度蛋白，獲得低豐度蛋白富集的待測樣品II，其中初始樣品A和初始樣品B來自同一受試者的同一份體液樣品；對待測樣品I進行蛋白質(zhì)組學分析，獲得蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集I；對待測樣品II進行蛋白質(zhì)組學分析，獲得蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集II；基于所述蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集I和所述蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集II，確定體液中最終定量的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集。