本發(fā)明涉及用于對廣泛種類的分析物進(jìn)行實(shí)時(shí),快速檢測,鑒定和計(jì)數(shù)的系統(tǒng)和方法,所述分析物包括,但不限于,細(xì)胞(真核,真細(xì)菌,古細(xì)菌),微生物,細(xì)胞器,病毒,蛋白質(zhì)(重組或天然蛋白質(zhì)),核酸,朊病毒,和任何化學(xué)品,代謝物或生物標(biāo)記物。所述系統(tǒng)和方法,包括激光/光學(xué)/電子裝置,分析軟件,測試方法和試劑,和高通量自動(dòng)控制,特別適合于對被污染的食品,臨床樣品和環(huán)境樣品中的病原體和非病原體進(jìn)行檢測,鑒定和計(jì)數(shù)?？梢杂帽景l(fā)明檢測的其它微生物包括臨床病原體,原生動(dòng)物和病毒。