一種可替代魚粉的菌糠蛋白肽及其制備方法和在水產養(yǎng)殖中的應用，屬于微生物和水產養(yǎng)殖飼料技術領域。本發(fā)明以食用菌菌糠廢料為基礎原料，首先采用先靈芝菌，后釀酒酵母的分步固體發(fā)酵技術，將食用菌菌糠的原始營養(yǎng)物質充分轉化為高品質的菌體蛋白和多糖類；然后采用纖維素酶、食用菌水解酶和酵母抽提酶相結合的酶解技術，使蛋白質充分釋放并水解為短分子量的小肽；最后經濃縮、干燥，獲得富含易消化小肽，并具有較強DPPH自由基清除能力的菌糠蛋白肽產品。本發(fā)明具有菌糠利用率高、產品得率高、操作簡單，實用性強，便于推廣的優(yōu)點；用于水產養(yǎng)殖飼料，可部分替代魚粉，起到促進水生動物生長、提高飼料利用率的作用。