本發(fā)明公開了一種利用光合細菌對水產養(yǎng)殖廢水進行資源化處理的方法，將廢水預處理，后經光合細菌池、膜生物反應器進行過濾分離，出水經在線檢測達標排放；截留住的光合細菌菌體高壓勻漿破碎獲得細胞破碎液，分別經不同有機溶劑進行萃取、蒸餾依次獲得輔酶Q10、細胞色素、5?氨基乙酰丙氨酸或蛋白質，最后剩余的廢液經好氧生物處理后達標排放。本發(fā)明可以實現水產養(yǎng)殖廢水資源化處理再利用的方法，可以高效處理水產養(yǎng)殖廢水、同時獲得高價值資源物質的方法。