一種長短多桶負壓導管架海上風電基礎結構及其施工方法，包括導管架和裝在導管架底部的負壓桶結構，所述的負壓桶結構至少設有兩種不同長度的負壓桶桶體，負壓桶桶體沿導管架的周向均勻分布，不同長度的負壓桶桶體等間隔設置，負壓桶桶體通過連接件與導管架固定相接，負壓桶桶體的底端為開口端，負壓桶桶體的頂端為封閉端，封閉端上開有排氣孔，排氣孔處裝有排氣閥。本發(fā)明通過在導管架底部設長短不一的負壓桶桶體，每個負壓桶桶體頂部留有排氣閥，供下沉過程排氣用，增設不同長度的負壓桶桶體可滿足現(xiàn)場地質條件及承載力、穩(wěn)定性要求，避免出現(xiàn)局部或整體失穩(wěn)，適用于地質條件復雜海域，確保每個負壓桶桶體下沉到位，可用于軟黏土海域。