本發(fā)明涉及一種微生物檢測(cè)方法，具體屬于一種煤地質(zhì)微生物形態(tài)和數(shù)量的檢測(cè)方法。解決煤地質(zhì)微生物厭氧取樣技術(shù)手段無(wú)法完全避免摻入雜質(zhì)，對(duì)微生物樣品觀察檢測(cè)造成干擾，難以區(qū)分樣品雜質(zhì)和微生物菌體等問(wèn)題，包括如下步驟：1）煤樣或水樣采集,2）微生物菌體的收集,3）菌體前處理：（4）熒光顯微鏡分析,（5）微生物形態(tài)分析，（6）微生物數(shù)量分析。適用于煤層、油氣或頁(yè)巖氣地層等環(huán)境中微生物形態(tài)和數(shù)量的分析。