一種分子生物學技術領域的分子鑒別方法。該檢測方法包括如下步驟:從紅豆杉中分離內生真菌并進行保藏和培養(yǎng);將培養(yǎng)的內生真菌菌絲體洗滌沉淀,研磨成粉末狀;內生真菌DNA的提取和純化;PCR擴增、PCR產物的電泳檢測和特異基因序列的測定;通過從內生真菌中能否擴增出650BP大小的特異性條帶來區(qū)分該菌株是否產紫杉醇;通過化學檢測程序進一步確定結果的可靠性。本發(fā)明利用特異基因序列對內生真菌是否產紫杉醇進行簡單、快速、準確的初步鑒別,為進一步研發(fā)和使用奠定了基礎。