本實用新型公開了一種新型傳染性疾病智能防控系統(tǒng)，系統(tǒng)包括包括若干個便攜式電化學發(fā)光檢測儀器和云服務器，每個所述便攜式電化學發(fā)光檢測儀器分別與所述云端服務器連接；通過便攜式電化學發(fā)光檢測儀器對受試者或物品所感染的傳染性病原體的種類及豐度進行現(xiàn)場快速檢測，并將檢測結果上傳至云端服務器，云端服務器接收各個便攜式電化學發(fā)光檢測儀器實時發(fā)來的檢測結果，并將檢測結果分類匯總，形成細分區(qū)域化病毒載量匯總信息，通過該信息進行疾病區(qū)域風險評估及預警，從而能夠大大提高對于傳染性疾病的預防能力。