本發(fā)明公開了一種水體有機污染智能化溯源方法及系統(tǒng)，屬于環(huán)境分析化學技術領域。包括獲取受污染水體自上游至下游的若干水樣的高效液相色譜?串聯(lián)質譜的有機物分析檢測數(shù)據(jù)；根據(jù)所述分析檢測數(shù)據(jù)，對水樣中的有機物進行高通量篩查，確認水體中的污染物；根據(jù)所確定的污染物，通過網絡分析識別污染源；根據(jù)所識別的污染源以及所述污染源的受納水體中的有機污染物，利用機器學習分類模型，確定污染源中的關鍵污染物，量化其污染貢獻。本發(fā)明能夠在未知污染源的情況下，實現(xiàn)對污染源及其中關鍵污染物的智能化追溯，為水環(huán)境中有機污染的調查和管控提供技術支撐。