本發(fā)明實施例提供了一種中藥制劑非處方物種化學成分致病的分析方法及設備。所述方法包括：獲取中藥制劑非處方物種的化學成分，格式化后得到第一格式化化學成分；將STITCH數(shù)據(jù)庫中的化學成分格式化，得到第二格式化化學成分；將兩種格式化后的化學成分去重篩選，第一格式化化學成分得到CID編號，由此獲取非處方物種的化學成分與人體蛋白的關(guān)系文件；獲取人體蛋白之間的相互作用關(guān)系文件；獲取OMIM號與基因的關(guān)系文件，由此獲取人體蛋白之間的相互關(guān)系與OMIM號的關(guān)系的文件；根據(jù)前述三種關(guān)系文件，構(gòu)建相應關(guān)系網(wǎng)獲取致病關(guān)系。本發(fā)明實施例提供的中藥制劑非處方物種化學成分致病的分析方法及設備，可以分析中藥制劑非處方物種化學成分與人體致病的關(guān)系。