本申請公開了一種基于復合型耐鹽菌種的用于處理高鹽有機廢水的生物反應器，包括若干個通過連通管件依次串聯(lián)連通的厭氧反應器和好氧污水處理裝置，厭氧反應器的內(nèi)部下端固定設置有承托孔板，承托孔板上鋪設有填料粒子床層，厭氧反應器內(nèi)添加有耐鹽厭氧菌，且厭氧反應器的內(nèi)部底部均鋪設有第一布水管；相鄰兩個厭氧反應器通過連通管件進行串聯(lián)連通時，連通管件的前端進口設置有過水濾網(wǎng)并水平伸入至前一個厭氧反應器的上端內(nèi)部，連通管件的后端出口與后一個厭氧反應器內(nèi)部底部鋪設的第一布水管相通接；廢水經(jīng)厭氧處理后，流入好氧污水處理裝置進行好氧處理。本申請的裝置處理高鹽有機廢水的效率較高，且廢水處理成本低。