本發(fā)明提供了一種蠅蛆殼聚糖制備新方法,包括以下步驟:1)鹵蠅蛆預處理:去除雜質;2)蠅蛆殼用鹽酸溶液攪拌浸泡、洗滌;3)將經步驟2)洗滌的蠅蛆殼用氫氧化鈉溶液浸泡,去除廢物;4)將步驟3)得到的蠅蛆殼進行脫色,得到粗制蠅蛆甲殼素;5)粗制蠅蛆甲殼素用微波加熱法脫去乙?；?得到殼聚糖。利用本發(fā)明所述方法從蠅蛆殼中提取殼聚糖具有如下優(yōu)點:1)殼聚糖的脫乙酰度提高到94.4%,對照國家有關標準,已達到高脫乙酰度,產品質量提升了一個級別;2)殼聚糖回收率有升高;3)脫乙酰過程用時短,能耗低。