本發(fā)明公開了香樟葉綠體全基因組PCR擴(kuò)增引物及其應(yīng)用，屬于生物科學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。本申請設(shè)計了26對特異性樟葉綠體全基因組PCR擴(kuò)增引物，引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1?SEQ ID NO.52所示，將其應(yīng)用在香樟葉綠體全基因組序列PCR擴(kuò)增、香樟品種鑒定和樟科葉綠體基因組系統(tǒng)發(fā)育研究中，完成了5個香樟不同化學(xué)型個體葉綠體基因組的擴(kuò)增和Sanger測序，并基于貝葉斯法利用19個樟科植物的68個共有葉綠體蛋白編碼基因序列構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹。本發(fā)明引物重復(fù)性好，能夠特異性的擴(kuò)增出香樟葉綠體基因組序列，達(dá)到快速鑒別的目的，為香樟品種鑒定、親緣關(guān)系分析及遺傳進(jìn)化分析提供了重要的依據(jù)。