本文描述了用于制備用于來自細(xì)胞群體的RNA的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄物測(cè)序的DNA模板的方法。該方法需要將來自群體的細(xì)胞分配到單獨(dú)的反應(yīng)體積中，使得多個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)體積各自含有單個(gè)分離的細(xì)胞，其中細(xì)胞在分配之前已經(jīng)用固定劑處理。然后使分離的細(xì)胞透化或破碎，并通過逆轉(zhuǎn)錄物制備cDNA，然后擴(kuò)增。還提供了用于從單細(xì)胞中的T細(xì)胞受體或免疫球蛋白有效產(chǎn)生DNA模板的新化學(xué)方法(chemistry)。