一種生物濾池高效的自養(yǎng)脫氮方法屬于廢水自養(yǎng)脫氮領(lǐng)域。步驟為：接種CANON工藝生物膜，通過先厭氧后好氧的啟動方式成功啟動自養(yǎng)脫氮生物濾池；反應(yīng)器啟動成功后，通過控制進(jìn)水流量和曝氣量，增加反應(yīng)器的氣水比，即曝氣量與進(jìn)水流量之比，不斷提高反應(yīng)器的去除負(fù)荷。當(dāng)反應(yīng)器的氨氮去除率大于99%時(shí)，提高進(jìn)水流量；當(dāng)出水亞硝酸鹽氮的濃度小于30mg/L時(shí)，增大曝氣量；最終反應(yīng)器總氮去除率達(dá)到80%～89%，總氮去除負(fù)荷達(dá)到1.0～3.11kgN·m-3·d-1，實(shí)現(xiàn)了高效的自養(yǎng)脫氮。本發(fā)明解決了全程自養(yǎng)脫氮反應(yīng)器處理負(fù)荷較低的問題，提供了一種生物濾池全程自養(yǎng)脫氮的高效運(yùn)行方法。