本發(fā)明公開了一種深海沉積物來源新型酯酶EST4及其編碼基因與應用。一種深海來源酯酶基因est4由宏基因組篩選獲得，核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示，其編碼的酯酶EST4氨基酸序列如SEQ?ID?NO.2所示。本發(fā)明所述的酯酶基因經(jīng)異源表達后，底物為對硝基苯酚己酸酯(C6)時催化活性最高，酶活為56.1U/mg。酯酶EST4酯酶催化水解最適溫度為35℃～40℃；在Ca2+、Co2+、Sr2+和Zn2+存在下酶學活性增大。該酯酶可應用于手性藥物合成、食品加工及食品風味改良、廢水處理和洗滌工業(yè)等工業(yè)生產(chǎn)。