本發(fā)明涉及使用散布在靶標多核苷酸中的銜接頭來獲得靶標序列的核苷酸序列信息的方法和組合物。該序列信息可以是新的,例如對未知核酸測序、再測序或者基因型分裂。本發(fā)明優(yōu)選地包括在靶標多核苷酸或者多核苷酸片段內的間隔位置上插入多個銜接頭的方法。這樣的銜接頭可以充當平臺,用于通過不同的測序化學法,例如那些通過引物延伸、探針連接等來鑒別核苷酸的測序化學法來起到詢問鄰近的序列的測序化學法。本發(fā)明涵蓋這樣的方法和組合物,用于將已知的銜接頭序列插入靶標序列,使得連續(xù)的靶標序列被銜接頭所中斷。通過對銜接頭的“上游”和“下游”兩者測序,可以完成整個靶標序列的鑒定。