本發(fā)明公開了一種基于高穩(wěn)定毛細(xì)管電泳分離分析技術(shù)的分子成像方法，涉及分析化學(xué)、生命科學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、醫(yī)藥開發(fā)和材料學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域。本發(fā)明的分子成像方法，包括樣品預(yù)處理、高穩(wěn)定毛細(xì)管電泳進(jìn)樣、分離和分析以及分子分布圖像繪制的步驟。樣品預(yù)處理采用網(wǎng)格刀法，包括均勻分割和原位萃取、富集和衍生等步驟。本發(fā)明利用毛細(xì)管電泳的強(qiáng)大分離能力和豐富的分離模式，成像要素豐富，可以對(duì)質(zhì)譜難分辨的中性分子、質(zhì)荷比相同的成分進(jìn)行成像。毛細(xì)管陣列電泳的批處理能力，可以加快分離過(guò)程，縮短成像分析時(shí)間。借助高穩(wěn)定毛細(xì)管電泳技術(shù)，可以穩(wěn)定分離成分的出峰位置，方便成分的鑒別和定位，進(jìn)而構(gòu)建出穩(wěn)定出峰成分的空間分布圖像。