本發(fā)明涉及醫(yī)療廢棄物處理技術(shù)領(lǐng)域，具體為一種醫(yī)療廢棄物多級(jí)滅菌系統(tǒng)，包括進(jìn)料殼體、進(jìn)料口、出料口、進(jìn)料電機(jī)、螺旋轉(zhuǎn)動(dòng)軸以及分離機(jī)構(gòu)，所述進(jìn)料殼體的外圓面上端靠近一側(cè)邊緣位置開設(shè)有進(jìn)料口；所述進(jìn)料殼體的一端中間位置固定連接有進(jìn)料電機(jī)，且所述進(jìn)料電機(jī)的輸出端貫穿進(jìn)料殼體的外表面延伸至進(jìn)料殼體內(nèi)部；所述進(jìn)料電機(jī)的輸出端固定連接有螺旋轉(zhuǎn)動(dòng)軸；所述進(jìn)料殼體的外圓面下端靠近另一側(cè)邊緣位置開設(shè)有出料口；所述出料口的下端固定連接有分離機(jī)構(gòu)。本發(fā)明能夠有效的進(jìn)行固液分離，并對(duì)固體廢棄物和液體廢棄物分別進(jìn)行處理，能夠有效的防止醫(yī)療廢棄物對(duì)空氣造成污染和對(duì)工作人員造成感染。