本實用新型提供了一種硫自養(yǎng)反硝化深度脫氮系統(tǒng)，包括填料床，所述填料床內設有反應顆粒，所述填料床的進水口通過管路連接廢水，所述填料床的出水口通過管路連接排水系統(tǒng)，所述填料床的底部通過管路連接反沖洗系統(tǒng)。本實用新型提供的硫自養(yǎng)反硝化深度脫氮系統(tǒng)具有占地面積小、結構簡單、處理效率高、易于操作、反應器內部易于形成厭氧環(huán)境等優(yōu)點；且填料床內填料區(qū)的填料一次性投加，可以定期進行補充。