本發(fā)明請求保護一種制藥工業(yè)廢水的深度處理方法及其應用，屬于廢水處理領域。為了克服現(xiàn)有技術中存在的工藝適用廣普性低、處理成本高、操作繁瑣和污染物處理不徹底等不足，本發(fā)明提供一種新型的廣普性制藥廢水深度處理工藝，該工藝中廢水依次經過催化還原改性、生物均質改善、催化氧化處理和高效生物降解四個處理單元處理后，COD含量小于50mg/L，能夠滿足地方廢水排放標準，該深度處理方法可以適用于各類制藥廢水的深度處理，尤其適用于含雜環(huán)化合物的制藥廢水深度處理，其用于各類制藥廢水處理時具有處理成本低，操作簡單，污染物去除率高以及工藝穩(wěn)定性強等優(yōu)點，適合在廢水處理中廣泛使用。