本發(fā)明提供了一種分層級異孔共價有機骨架材料及其制備方法和應(yīng)用，通過異孔共價有機骨架和金屬有機骨架的物理包覆作用制成復(fù)合材料，復(fù)合材料以金屬有機骨架作為犧牲模板，通過溶解劑溶解金屬有機骨架合成分層級異孔共價有機骨架材料，本發(fā)明所述的分層級異孔共價有機骨架材料對食品和農(nóng)產(chǎn)品中的色素分子具有優(yōu)異的快速凈化能力，結(jié)合液相色譜或質(zhì)譜聯(lián)用分析技術(shù)進行食品和農(nóng)產(chǎn)品樣品的農(nóng)藥殘留含量的檢測分析，可實現(xiàn)化學(xué)危害因子全回收。